上样孔里加样的时候样品是有一定的高度的，样品里的蛋白没有站在一条起跑线上。浓缩胶的作用就是压缩样品中的蛋白质成为一条细线站在同一条起跑线上，这样影响蛋白迁移速率的因素就只有分子量的大小了，也就更有可比性了。
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